Cara mbukak, nyunting, lan ngonversi file PDB
Berkas mawa ekstensi file PDB paling kamungkinan berkas sing digawe ing format Database Program sing digunakake kanggo nahan informasi debugging babagan program utawa modul, kaya file DLL utawa EXE . Kadhangkala disebut file simbol.
PDB nggambaraké manéka komponen lan pernyataan ing kode sumber menyang produk sing wis dikompilasi pungkasan, sing bisa digunakake debugger kanggo nemokake file sumber lan lokasi sing bisa dieksekusi ing ngendi proses kasebut kudu mandhekake proses debugging.
Sawetara file PDB bisa uga kasebut ing format file Protein Data Bank. File PDB kasebut minangka file teks kosong sing nyimpen koordinat babagan struktur protein.
File PDB liya bisa uga digawe ing format file Palm utawa PalmDOC lan digunakake karo sistem operasi mobile PalmOS. Sawetara file ing format iki nggunakake ekstensi file .PRC.
Carane Mbukak File PDB
Program beda nggunakake file PDB dhewe kanggo nyimpen data ing sawetara format format basis data, supaya saben aplikasi digunakake kanggo mbukak file PDB jinis dhewe. Genius, Intuit Quicken, Microsoft Visual Studio, lan Pegasus mung sawetara conto program sing bisa nggunakake file PDB minangka file basis data. Radare lan PDBparse bisa uga mbukak file PDB.
Sawetara file PDB disimpen minangka teks biasa, kaya file Database Program Debug Geneious, lan bisa dibaca kanthi manawa yen dibukak ing editor teks. Sampeyan bisa mbukak file PDB jinis kasebut karo program sing bisa maca dokumen teks, kaya program Notepad ing Windows. Sawetara penampil lan editor file PDB liyane kalebu Notepad ++ lan Braket.
File database PDB liyane ora dadi dokumen teks lan mung migunani nalika dibukak karo program sing dimaksudake kanggo. Contone, yen file PDB sampeyan ana hubungane karo sawetara cara kanggo Quicken, banjur coba nggunakake piranti lunak kasebut kanggo ndeleng utawa ngowahi file PDB. Visual Studio ngarepake ndeleng file PDB ing folder sing padha karo file DLL utawa EXE.
Sampeyan bisa ndeleng lan ngedit file PDB sing ana file Protein Data Bank, ing Windows, Linux, lan macOS kanthi Avogadro. Jmol, RasMol, QuickPDB, lan USCF Chimera bisa mbukak file PDB uga. Awit file-file kasebut minangka teks kosong, sampeyan uga bisa mbukak file PDB ing editor teks.
Desktop Palm kudu bisa mbukak file PDB sing ana ing format file Database Palm, nanging sampeyan kudu ngganti jeneng pisanan kanggo nduwe extension file .PRC kanggo program kasebut kanggo ngenali. Kanggo mbukak file PDB PalmDOC, nyoba STDU Viewer.
Cara Ngonversi File PDB
Program Database file bisa paling ora bisa diowahi menyang format file beda, paling ora karo piranti converter file biasa . Nanging, yen ana alat sing bisa ngowahi file PDB iki, dadi program sing padha bisa mbukak.
Contone, yen sampeyan kudu ngowahi file database PDB saka Quicken, coba nggunakake program kasebut kanggo nindakake. Nanging, jinis konversi iki mbokmenawa ora mung nggunakake sethithik nanging uga ora didhukung ing aplikasi database kasebut (misale sampeyan mbokmenawa ora perlu ngowahi file PDB kaya format liyane).
File Data Protein Bank bisa diowahi menyang format liya karo MeshLab. Kanggo nindakake iki, sampeyan kudu ngonversi file PDB dhisik menyang WRL karo PyMOL saka File> Save Image As> menu VRML , banjur ngimpor file WRL ing MeshLab lan nggunakake File> Export Mesh As menu kanggo ngonversine PDB file menyang STL utawa format file liyane.
Yen sampeyan ora perlu model dadi werna, sampeyan bisa ngekspor file PDB langsung menyang STL karo USCF Chimera (link download ing ndhuwur). Yen ora, sampeyan bisa nggunakake cara sing padha kaya ing ndhuwur (karo MeshLab) kanggo ngonversi PDB menyang WRL karo USCF Chimera lan banjur ngekspor berkas WRL menyang STL nganggo MeshLab.
Kanggo ngonversi PDB menyang PDF utawa EPUB , yen sampeyan duwe file PalmDOC, bisa sawetara cara nanging sing paling gampang mbokmenawa nggunakake konverter PDB online kaya Zamzar . Sampeyan bisa ngunggah file PDB menyang situs web kasebut supaya bisa ngowahi format kasebut ing format format AZW3, FB2, MOBI , PML, PRC, TXT, lan format e-book liyane.
Kanggo ngonversi file PDB menyang format FASTA bisa rampung karo PDB online Meiler Lab kanggo konverter FASTA.
Sampeyan uga bisa ngonversi PDB menyang CIF (Crystallographic Format format) online nggunakake PDBx / mmCIF.
Advanced Reading on PDB Files
Sampeyan bisa maca luwih akeh babagan file Database Program saka Microsoft, GitHub, lan Wintellect.
Ana liyane kanggo mangerteni file Protein Data Bank uga; ndeleng Protein Data Bank Worldwide lan RCSB PDB.
Apa File Sampeyan isih Ora Mbukak?
File PDB sing ora mbukak karo piranti apa wae saka ndhuwur, mbokmenawa ora bener PDB file. Apa sing kedadeyan iku sampeyan salah maca ekstensi file; sawetara format file nggunakake suffix sing meh mirip ".PDB" nalika padha pancen ora ana hubungane lan ora bisa ngerjakake sing padha.
Contone, file PDF minangka file document nanging paling program saka ndhuwur ora menehi teks lan / utawa gambar kanthi bener yen sampeyan nyoba mbukak program lunak kasebut. Wigati uga kanggo file liya kanthi ekstensi file sing diejo, kayata file PD, PDE, PDC, lan PDO.
PBD liya sing kalebu program EaseUS Todo Backup lan mulane mung migunake nalika dibukak karo piranti lunak kasebut.
Yen sampeyan ora duwe file PDB, banjur riset ekstensi file kasebut supaya sampeyan bisa nemokake program sing mbukak utawa ngowahi.